Jugando al Screencaster

En lugar de escribir documentación para un cambio largo de explicar en un sistema, hice un screencast. Usé recordMyDesktop en Ubuntu, el cual ha hecho una muy buena grabación. Pero tengo dos problemas ahora.
Primero, el micrófono no funciona bien en Crimson, mi netbook, así que grabé el audio en Ocelot, mi PC secundaria con Windows XP Pro. Tengo que editar el video para unirlos.
Segundo, el video es un Ogg Theora que VLC reproduce muy bien pero al momento de convertirlo a MPEG4 o similar, Windows Movie Maker se rehúsa a leerlo.

Ando perdiendo tiempo (léase: días) en conversiones de video insatisfactorias. Lo más drástico que se me ocurre intentar es reproducir el video con VLC y el WAV con mplayer en Crimson y hacer que recordMyDesktop vuelva a grabarlo todo como screencast.